Nel 2009 è stata predisposta ed approvata la proposta per la prosecuzione del progetto nell'ambito del programma IPA CBC SI-HR 2007-2013 con il nome PARENZANA II – Rivitalizzazione del Sentiero della salute e dell'amicizia.
Nell'ambito del progetto sono stati ristrutturati i tratti Visinada-Parenzo e Lama-Dekani, è stato costruito il ponte a Levade e a Visinade è stato apposto il modello della locomotiva della Parenzana a grandezza naturale. Lungo il tragitto sono state poste le copie delle pietre miliari, tabelle informative in diverse lingue, tabelle segnaletiche e tematiche e sistemate diverse aree di sosta.
Si è proceduto con la formazione di quattro guide ciclistiche ed il posizionamento di diversi info bike point ed info point per garantire una migliore e maggiore informazione sui servizi. Durante il progetto è stato ampliato e ristrutturato anche il museo multimediale della Parenzana a Levade, che si trova proprio vicino al tracciato.